北京同仁堂科技发展股份有限公司经营分公司是科技公司核心经营企业，2002年年初组建。其前身是原同仁堂集团公司市内商业公司。经营分公司内部组织机构合理，业务流程规范、高效，采用网络化营销管理系统对日常营销业务工作进行全方位的管理。经营分公司不仅拥有一支观念创新、团结进取的营销队伍，同时拥有副主任药师、执业药师、主管药师、中药师、药士等40多名专业人士。

    经营分公司有着20多年的销售经验，承担着北京同仁堂科技发展股份有限公司的主要销售任务。经营丸剂、片剂、颗粒剂、微丸剂、水丸剂、口服液等多种剂型，经营品种包括京制牛黄解毒片、六味地黄丸系列、感冒清热冲剂、板兰根冲剂、感冒软胶囊等七十多个品种。